TypingMindTypingMindThe best frontend for AI
Genome Analyzer logo

Genome Analyzer

Community
artwist-polyakov
genome-analyzer

Анализирует генетические данные пользователя из VCF файла. Используй когда пользователь спрашивает о своей генетике, наследственных признаках, предрасположенностях, метаболизме веществ (кофеин, алкоголь, лекарства), спортивных способностях, рисках заболеваний, питании на основе генов.

Overview

Publisherartwist-polyakov
Repositorypolyakov-claude-skills
Skill namegenome-analyzer
Stars
218
Forks
55
Bundled files
Instructions only
LicenseMIT
Links
Skill sourceRepository
  • Markdown instructions

    A SKILL.md file the model loads on demand, so it only costs tokens when a request actually matches.

  • Works with any LLM

    AI skills are plain Markdown, not provider-specific code, so this works with GPT, Claude, Gemini, Grok, or a local model.

  • Self-contained

    Everything the model needs lives in the instructions — no extra files to sync.

  • Open source

    Published by artwist-polyakov on GitHub. Read the source before you install it.

Installation

Install the Genome Analyzer AI skill in TypingMind to use it with any LLM, or drop it into another agent that reads SKILL.md.

1

Install in TypingMind

TypingMind installs a skill straight from its GitHub folder — it reads SKILL.md, bundles the resource files, and stores the result locally.

  1. Open the app and go to Plugins → Skills.
  2. Choose "Install from GitHub".
  3. Paste the skill folder URL below and confirm.
    https://github.com/artwist-polyakov/polyakov-claude-skills/tree/main/plugins/genome-analizer/skills/genome-analizer
  4. Enable the skill in any chat where you want it available.
Plugins → Skills → Add skill → From GitHub URL, then paste the folder URL and press Continue.
2

Install in another agent

Any agent that reads the Agent Skills format can use this skill — copy the folder into that agent's skills directory.

Claude Code — .claude/skills
git clone --depth 1 https://github.com/artwist-polyakov/polyakov-claude-skills.git /tmp/polyakov-claude-skills
mkdir -p .claude/skills
cp -r /tmp/polyakov-claude-skills/plugins/genome-analizer/skills/genome-analizer .claude/skills/genome-analyzer
Restart Claude Code after copying so it picks up the new skill.

Use it in TypingMind

Enable Genome Analyzer in any TypingMind chat and the model takes it from there. Its name and description sit in the system prompt, and the moment a request matches, the model loads the full instructions itself — you never invoke it by hand, and it costs no tokens until it is actually used.

The model loads Genome Analyzer on its own as soon as a request matches it.

Works with any AI model

AI skills are plain Markdown instructions rather than provider-specific code, so Genome Analyzer is not tied to the model it was written for. Install it once in TypingMind and use it with GPT-5, Claude, Gemini, Grok, DeepSeek, Mistral, Llama, or a local model you run yourself — all on your own API keys.

  • Loaded only when it is needed

    The system prompt carries just the name and description. The instructions are fetched on the first matching request, so an idle skill costs nothing.

  • Switch models mid-chat

    Because the skill is instructions rather than code, changing model does not break it — the next model reads the same SKILL.md.

Skill instructions

This is the SKILL.md content the model loads. Read it before installing — a skill is instructions your model will follow.

Genome Analyzer

Ты анализируешь генетические данные пользователя из VCF файла.

VCF файл

VCF файл находится в текущей директории. Имя файла может быть любым (*.vcf).

Алгоритм работы

Шаг 0: Найти VCF файл

Используй Glob для поиска VCF файла в текущей директории:

  • pattern: *.vcf

Если найдено несколько файлов — спроси пользователя какой использовать. Если файл не найден — сообщи пользователю.

Шаг 1: Исследование темы

Запусти агента для поиска релевантных SNP по теме вопроса пользователя.

Используй Task tool с параметрами:

  • subagent_type: "general-purpose"
  • model: "sonnet"
  • prompt: Поиск SNP (rsID), связанных с темой вопроса

Агент должен:

  • Использовать WebSearch для поиска генов и SNP по теме
  • Искать в источниках: GWAS Catalog, SNPedia, научные статьи
  • Вернуть список rsID с описанием эффектов каждого аллеля (risk/protective)

Шаг 2: Поиск в геноме

Используй Grep для поиска найденных rsID в VCF файле (путь из Шага 0):

  • pattern: rs123456|rs789012|rs... (объединить через |)
  • path: путь к VCF файлу из Шага 0
  • output_mode: "content"

Шаг 3: Интерпретация генотипов

Расшифруй генотипы из VCF:

  • 0/0 = гомозигота по референсу (REF/REF)
  • 0/1 = гетерозигота (REF/ALT)
  • 1/1 = гомозигота по альтернативе (ALT/ALT)

Сопоставь генотип с информацией об аллелях из Шага 1.

Формат ответа

ВАЖНО: Отчёт должен быть визуально привлекательным, структурированным и понятным. Используй эмодзи, таблицы, выделение текста.

Шаблон отчёта:

markdown
## [Эмодзи] [Тема анализа]

### Основные результаты

| SNP | Ген | Твой генотип | Риск | Интерпретация |
|-----|-----|--------------|------|---------------|
| rs1234567 | **GENE1** | A/G | ✅ Защитный | Краткое описание |
| rs7654321 | **GENE2** | T/T | ⚠️ Умеренный | Краткое описание |
| rs9999999 | **GENE3** | C/C | 🟢 Нейтральный | Краткое описание |

---

### 📊 Что это значит

**Твой профиль: [краткая характеристика в 3-5 слов]**

**Сильные стороны:**
- [Пункт 1 с объяснением]
- [Пункт 2 с объяснением]

**Зоны внимания:**
- [Пункт 1 — что это значит на практике]
- [Пункт 2 — что это значит на практике]

---

### 🎯 Практические рекомендации

1. **[Рекомендация 1]** — почему это важно с твоей генетикой
2. **[Рекомендация 2]** — конкретный совет
3. **[Рекомендация 3]** — что делать/не делать

---

### 📈 Итоговая оценка

| Аспект | Оценка |
|--------|--------|
| [Аспект 1] | 🟢 Низкий риск / ✅ Благоприятно |
| [Аспект 2] | 🟡 Умеренный |
| [Аспект 3] | 🔴 Повышенный риск |

---

### ⚠️ Дисклеймер

Генетика — это вероятности, не судьба. Окружающая среда, образ жизни и привычки часто важнее генов. Это информационный анализ, не медицинская консультация.

**Источники:** [SNPedia](https://snpedia.com), [GWAS Catalog](https://www.ebi.ac.uk/gwas/)

Эмодзи для оформления

Заголовки по темам:

  • 🏃 Спорт/фитнес
  • ⚖️ Вес/ожирение
  • 🧠 Зависимости/психика
  • ☕ Кофеин
  • 🍷 Алкоголь
  • 🥛 Питание/непереносимости
  • 💊 Лекарства
  • ❤️ Сердце/сосуды
  • 🧬 Общая генетика

Уровни риска в таблицах:

  • ✅ Защитный/благоприятный
  • 🟢 Нейтральный/стандартный
  • 🟡 Умеренный риск
  • ⚠️ Повышенное внимание
  • 🔴 Высокий риск

Стиль написания

  • Пиши простым языком, избегай научного жаргона
  • Объясняй что означает каждый генотип НА ПРАКТИКЕ
  • Давай конкретные, actionable рекомендации
  • Используй жирный текст для выделения важного
  • Разбивай текст на короткие абзацы
  • Добавляй горизонтальные разделители --- между секциями
  • В таблицах используй эмодзи для визуального восприятия

Frequently asked questions

What does the Genome Analyzer AI skill do?

Анализирует генетические данные пользователя из VCF файла. Используй когда пользователь спрашивает о своей генетике, наследственных признаках, предрасположенностях, метаболизме веществ (кофеин, алкоголь, лекарства), спортивных способностях, рисках заболеваний, питании на основе генов.

Why use Genome Analyzer on TypingMind?

Because you install it once and use it with any model. Genome Analyzer is plain Markdown rather than provider-specific code, so the same skill runs on GPT-5, Claude, Gemini, Grok, or a local model — and you can switch model mid-chat without it breaking. TypingMind runs on your own API keys, so you pay providers directly instead of a per-seat subscription, and your skills and chats stay in your own storage.

How do I install Genome Analyzer in TypingMind?

Open Plugins → Skills → Install from GitHub in TypingMind and paste https://github.com/artwist-polyakov/polyakov-claude-skills/tree/main/plugins/genome-analizer/skills/genome-analizer. TypingMind reads its SKILL.md and installs it as a skill you can enable per chat.

Which AI models can use Genome Analyzer?

Any model you connect in TypingMind. AI skills are plain Markdown instructions rather than provider-specific code, so GPT, Claude, Gemini, Grok, and local models can all load this skill when a request matches it.

How many AI models can I use with Genome Analyzer?

As many as you like. As long as a model supports skills, you can use Genome Analyzer with it — GPT, Claude, Gemini, Grok, DeepSeek, Mistral, Llama and more — all on TypingMind with your own API keys.

Is the Genome Analyzer AI skill free?

Yes. It is published on GitHub by artwist-polyakov under the MIT license. You only pay your own AI provider for the tokens you use.

What are AI skills?

An AI skill is a reusable instruction bundle that teaches an AI model how to do one specific task. It follows the open Agent Skills format: a SKILL.md file with a name and description, plus any scripts, templates or reference files the model may need. The model reads the instructions only when your request matches the skill, so an installed skill costs nothing until it is used.

How are AI skills different from plugins or MCP servers?

A plugin or MCP server gives a model new tools to call — code that runs somewhere and returns a result. An AI skill gives the model knowledge and process instead: how to approach a task, which steps to follow, what good output looks like. Skills are plain Markdown, so they need no server, no API key and no runtime, and they work with any model.

Related AI Skills

View all
CherryHQ logo

Skills Manager

CherryHQ
OrganizationPopular

搜索、安装和协调创建 Claude Code Agent Skills。当用户想要搜索技能、安装工具、创建自定义 Skill，或者说"find a skill"、"搜索技能"、"帮我做个 skill"、"create a skill"时触发。也适用于用户说"有没有做 X 的工具"、"我想扩展 Agent 能力"，或当前能力不足需要先查找可复用方案的场景。

5.1K
52.5K
Instructions
View
HKUDS logo

Cli Anything 3mf

HKUDS
OrganizationPopular

3MF mesh geometry editor — detect and resize cylindrical holes, repair meshes, compare 3D printing files. Works with BambuStudio and PrusaSlicer 3MF files.

4.6K
49.5K
Instructions
View
HKUDS logo

Cli Anything Godot

HKUDS
OrganizationPopular

Agent-native CLI for Godot project management, scenes, exports, and script execution.

4.6K
49.5K
Instructions
View
HKUDS logo

Cli Anything Intelwatch

HKUDS
OrganizationPopular

Zero friction. Full context. Competitive intelligence, M&A due diligence, and OSINT directly from your terminal. Uses Node.js/npx.

4.6K
49.5K
Instructions
View

Set up your own AI workspace now

Get notified about new features and future giveaways by subscribing to our newsletter 👇